| 順 | チーム | 試 合 | 勝 点 | 勝 | 分 | 敗 | 得 失 |
| 1 | 栃木シティFC | 30 | 64 | 19 | 7 | 4 | 29 |
| 2 | 高知ユナイテッドSC | 30 | 55 | 16 | 7 | 7 | 14 |
| 3 | FCティアモ枚方 | 30 | 50 | 15 | 5 | 10 | 4 |
| 4 | レイラック滋賀 | 30 | 48 | 14 | 6 | 10 | 17 |
| 5 | ヴィアティン三重 | 30 | 48 | 13 | 9 | 8 | 8 |
| 6 | ヴェルスパ大分 | 30 | 45 | 11 | 12 | 7 | 0 |
| 7 | Honda FC | 30 | 43 | 11 | 10 | 9 | 7 |
| 8 | ブリオベッカ浦安 | 30 | 42 | 12 | 6 | 12 | 3 |
| 9 | 沖縄SV | 30 | 41 | 11 | 8 | 11 | 8 |
| 10 | ラインメール青森 | 30 | 41 | 9 | 14 | 7 | 6 |
| 11 | アトレチコ鈴鹿クラブ | 30 | 37 | 10 | 7 | 13 | -3 |
| 12 | ソニー仙台 | 30 | 37 | 10 | 7 | 13 | -6 |
| 13 | FCマルヤス岡崎 | 30 | 30 | 6 | 12 | 12 | -9 |
| 14 | クリアソン新宿 | 30 | 26 | 5 | 11 | 14 | -25 |
| 15 | 横河武蔵野FC | 30 | 23 | 5 | 8 | 17 | -30 |
| 16 | ミネベアミツミFC | 30 | 22 | 5 | 7 | 18 | -23 |