| 順 | チーム | 試 合 | 勝 点 | 勝 | 分 | 敗 | 得 失 |
| 1 | ヴァンラーレ八戸 | 22 | 46 | 14 | 4 | 4 | 16 |
| 2 | FC大阪 | 22 | 44 | 13 | 5 | 4 | 19 |
| 3 | 栃木シティFC | 22 | 44 | 13 | 5 | 4 | 13 |
| 4 | 鹿児島ユナイテッドFC | 22 | 38 | 10 | 8 | 4 | 12 |
| 5 | テゲバジャーロ宮崎 | 22 | 35 | 9 | 8 | 5 | 5 |
| 6 | 奈良クラブ | 22 | 34 | 9 | 7 | 6 | 4 |
| 7 | ギラヴァンツ北九州 | 22 | 33 | 10 | 3 | 9 | 2 |
| 8 | 高知ユナイテッドSC | 22 | 31 | 8 | 7 | 7 | -3 |
| 9 | 松本山雅 | 22 | 29 | 8 | 5 | 9 | -2 |
| 10 | ガイナーレ鳥取 | 22 | 28 | 8 | 4 | 10 | -3 |
| 11 | SC相模原 | 22 | 27 | 6 | 9 | 7 | -4 |
| 12 | 福島ユナイテッドFC | 22 | 27 | 7 | 6 | 9 | -12 |
| 13 | FC琉球 | 22 | 26 | 7 | 5 | 10 | -3 |
| 14 | ツエーゲン金沢 | 22 | 26 | 7 | 5 | 10 | -4 |
| 15 | 栃木SC | 22 | 26 | 7 | 5 | 10 | -4 |
| 16 | ザスパ群馬 | 22 | 24 | 5 | 9 | 8 | -4 |
| 17 | AC長野パルセイロ | 22 | 24 | 6 | 6 | 10 | -8 |
| 18 | カマタマーレ讃岐 | 22 | 20 | 5 | 5 | 12 | -7 |
| 19 | FC岐阜 | 22 | 19 | 4 | 7 | 11 | -12 |
| 20 | アスルクラロ沼津 | 22 | 18 | 3 | 9 | 10 | -5 |