| 順 | チーム | 試 合 | 勝 点 | 勝 | 分 | 敗 | 得 失 |
| 1 | Honda_FC | 30 | 63 | 19 | 6 | 5 | 29 |
| 2 | ソニー仙台 | 30 | 55 | 16 | 7 | 7 | 26 |
| 3 | FC今治 | 30 | 51 | 13 | 12 | 5 | 15 |
| 4 | 東京武蔵野シティFC | 30 | 48 | 13 | 9 | 8 | 5 |
| 5 | テゲバジャーロ宮崎 | 30 | 41 | 11 | 8 | 11 | 3 |
| 6 | ホンダロック | 30 | 41 | 10 | 11 | 9 | 2 |
| 7 | ヴェルスパ大分 | 30 | 40 | 10 | 10 | 10 | 6 |
| 8 | FC大阪 | 30 | 40 | 10 | 10 | 10 | 1 |
| 9 | MIOびわこ滋賀 | 30 | 40 | 11 | 7 | 12 | -13 |
| 10 | ヴィアティン三重 | 30 | 39 | 10 | 9 | 11 | 4 |
| 11 | FCマルヤス岡崎 | 30 | 38 | 9 | 11 | 10 | 0 |
| 12 | 鈴鹿アンリミテッド | 30 | 36 | 9 | 9 | 12 | -4 |
| 13 | ラインメール青森 | 30 | 36 | 9 | 9 | 12 | -4 |
| 14 | 奈良クラブ | 30 | 34 | 8 | 10 | 12 | -5 |
| 15 | 松江シティFC | 30 | 25 | 5 | 10 | 15 | -25 |
| 16 | 流経大ドラゴンズ龍ケ崎 | 30 | 21 | 5 | 6 | 19 | -40 |