| 順 | チーム | 試 合 | 勝 点 | 勝 | 分 | 敗 | 得 失 |
| 1 | 大宮アルディージャ | 14 | 33 | 10 | 3 | 1 | 17 |
| 2 | FC琉球 | 14 | 23 | 6 | 5 | 3 | 3 |
| 3 | アスルクラロ沼津 | 14 | 22 | 6 | 4 | 4 | 8 |
| 4 | SC相模原 | 14 | 22 | 5 | 7 | 2 | 5 |
| 5 | ツエーゲン金沢 | 14 | 22 | 6 | 4 | 4 | 3 |
| 6 | FC大阪 | 14 | 21 | 5 | 6 | 3 | 6 |
| 7 | カターレ富山 | 14 | 21 | 5 | 6 | 3 | 2 |
| 8 | 福島ユナイテッドFC | 14 | 20 | 6 | 2 | 6 | 6 |
| 9 | AC長野パルセイロ | 14 | 20 | 5 | 5 | 4 | 1 |
| 10 | 松本山雅 | 14 | 20 | 5 | 5 | 4 | -1 |
| 11 | FC今治 | 14 | 20 | 6 | 2 | 6 | -2 |
| 12 | FC岐阜 | 14 | 19 | 5 | 4 | 5 | 4 |
| 13 | Y.S.C.C.横浜 | 14 | 17 | 4 | 5 | 5 | -3 |
| 14 | ガイナーレ鳥取 | 14 | 17 | 4 | 5 | 5 | -7 |
| 15 | ギラヴァンツ北九州 | 14 | 15 | 3 | 6 | 5 | -1 |
| 16 | ヴァンラーレ八戸 | 14 | 15 | 3 | 6 | 5 | -2 |
| 17 | 奈良クラブ | 14 | 15 | 3 | 6 | 5 | -3 |
| 18 | カマタマーレ讃岐 | 14 | 11 | 1 | 8 | 5 | -6 |
| 19 | テゲバジャーロ宮崎 | 14 | 10 | 2 | 4 | 8 | -8 |
| 20 | いわてグルージャ盛岡 | 14 | 9 | 2 | 3 | 9 | -22 |