| 順位 | チーム | 試合 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得失 |
| 1 | ソニー仙台 | 30 | 71 | 21 | 8 | 1 | 27 |
| 2 | Honda_FC | 30 | 68 | 21 | 5 | 4 | 51 |
| 3 | 鹿児島ユナイテッドFC | 30 | 60 | 18 | 6 | 6 | 21 |
| 4 | ヴァンラーレ八戸 | 30 | 59 | 17 | 8 | 5 | 15 |
| 5 | アスルクラロ沼津 | 30 | 54 | 16 | 6 | 8 | 8 |
| 6 | SP京都FC | 30 | 50 | 14 | 8 | 8 | 25 |
| 7 | 奈良クラブ | 30 | 46 | 13 | 7 | 10 | 5 |
| 8 | FC大阪 | 30 | 44 | 13 | 5 | 12 | 10 |
| 9 | ホンダロック | 30 | 40 | 11 | 7 | 12 | -6 |
| 10 | ヴェルスパ大分 | 30 | 37 | 10 | 7 | 13 | -7 |
| 11 | MiOびわこ滋賀 | 30 | 34 | 9 | 7 | 14 | -5 |
| 12 | 横河武蔵野FC | 30 | 30 | 8 | 6 | 16 | -9 |
| 13 | FCマルヤス岡崎 | 30 | 21 | 6 | 3 | 21 | -34 |
| 14 | 流経大ドラゴンズ龍ヶ崎 | 30 | 21 | 6 | 3 | 21 | -35 |
| 15 | ファジアーノ岡山ネクスト | 30 | 20 | 6 | 2 | 22 | -34 |
| 16 | 栃木ウーヴァSC | 30 | 19 | 5 | 4 | 21 | -32 |
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