| 順位 | チーム | 試合 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得失 |
| 1 | Honda_FC | 30 | 79 | 25 | 4 | 1 | 51 |
| 2 | FC大阪 | 30 | 57 | 18 | 3 | 9 | 20 |
| 3 | ヴァンラーレ八戸 | 30 | 56 | 16 | 8 | 6 | 22 |
| 4 | ソニー仙台 | 30 | 52 | 16 | 4 | 10 | 24 |
| 5 | FC今治 | 30 | 49 | 14 | 7 | 9 | 31 |
| 6 | 東京武蔵野シティFC | 30 | 49 | 14 | 7 | 9 | 13 |
| 7 | MiOびわこ滋賀 | 30 | 46 | 13 | 7 | 10 | 3 |
| 8 | 奈良クラブ | 30 | 42 | 12 | 6 | 12 | 1 |
| 9 | ヴェルスパ大分 | 30 | 39 | 11 | 6 | 13 | -9 |
| 10 | ラインメール青森 | 30 | 37 | 10 | 7 | 13 | -10 |
| 11 | ヴィアティン三重 | 30 | 35 | 9 | 8 | 13 | -12 |
| 12 | テゲバジャーロ宮崎 | 30 | 32 | 9 | 5 | 16 | -17 |
| 13 | FCマルヤス岡崎 | 30 | 31 | 8 | 7 | 15 | -13 |
| 14 | ホンダロック | 30 | 29 | 6 | 11 | 13 | -23 |
| 15 | 流経大ドラゴンズ龍ヶ崎 | 30 | 19 | 4 | 7 | 19 | -32 |
| 16 | Cobaltore女川 | 30 | 17 | 4 | 5 | 21 | -49 |
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